84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002553 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002553  quorum-sensing regulator of virulence HapR  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  95.08 
 
 		 205 aa  367  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  60.34 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0115  hemagglutinin/protease regulatory protein  63.08 
 
 		 132 aa  188  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0116  hemagglutinin/protease regulatory protein  97.73 
 
 		 68 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  20.81 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  20.78 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  20.56 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  27.87 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.97 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  20.78 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  56.1 
 
 		 226 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 195 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 217 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 209 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 179 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 414 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 196 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 213 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 219 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  22.52 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  20.29 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  36.07 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 242 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  19.11 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>