297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2019 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  82.3 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  82.78 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  82.69 
 
 		 237 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  69.08 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 212 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 224 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 346 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.99 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  37.88 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  25.53 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 332 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 477 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 477 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>