More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2741 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  33.33 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 421 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  35.57 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  25.79 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.65 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  26.63 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  36.59 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>