More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6288 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2446  TetR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00126454  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.27 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 208 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  34.97 
 
 		 210 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  35.71 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30.58 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  49.21 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.06 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  48.05 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  45 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>