More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4915 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 367 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  32.52 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  33.01 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  35.26 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  26.92 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  28.88 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  31.28 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  31.28 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  31.28 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  31.28 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  31.28 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  31.28 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  31.28 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  30.57 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  30.93 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  26.6 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  28.98 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  31.12 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  27.54 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  30.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  30.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  30.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  27.16 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  30.67 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  32.32 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  29.19 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  29.19 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  29.86 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  29.9 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  29.19 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  27.5 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  29.9 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  28.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  28.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  28.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  28.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  26.11 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  34.43 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  27.5 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  26.8 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  27.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  34.68 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  28.12 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  22.08 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>