More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7448 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  26.88 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  27.92 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  44.64 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  28.43 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  18.87 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.86 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  30.34 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.28 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.28 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>