More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0280 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  35.57 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  36.04 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 367 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  35.03 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  29.17 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  27.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  23.76 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  22.4 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15980  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47032  normal  0.185748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  24.35 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  25.65 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  25.25 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  24.75 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  27.32 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  36.76 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  25.3 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  22.93 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 287 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  26.95 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  28.89 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  26.95 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  26.95 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>