238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3495 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.17 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  30.83 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  32.76 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  30.59 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  27.12 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  28.07 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 677 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 510 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  26.09 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 212 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  29.57 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  26.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  26.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  26.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  26.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  24.81 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  26.87 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  30.19 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  36.71 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>