More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  39.09 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  43.56 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  39.17 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.68 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  30.43 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 367 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  26.5 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  35.48 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  30.07 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  30.07 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  37.65 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 141 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  30.15 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  29.25 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  36.49 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  30.15 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  38.81 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>