256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.83 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.35 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  38.02 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  29.63 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  34.19 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  33.59 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  46.55 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  49.21 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  30.17 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  31.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>