148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1610 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  94.47 
 
 		 199 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  85.22 
 
 		 203 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  85.22 
 
 		 203 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  85.22 
 
 		 203 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  71.29 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  46 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  50.81 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  32.94 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.25 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  55.36 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  51.92 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  40.48 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  27.46 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.76 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 428 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 429 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  32 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 308 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>