99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3434 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 188 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  43.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  61.54 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.51 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  41.38 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  55.32 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.62 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  46.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 429 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 166 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  34.88 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  31.45 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 357 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 178 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.24 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  24.24 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 205 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 189 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 203 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 198 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  34.02 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>