55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0095 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  383  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  49.29 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  35.12 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  36.73 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  36.76 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  50 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  31.31 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>