98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4038 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  53.46 
 
 		 188 aa  148  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  45.4 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  40.37 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  43.36 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.31 
 
 		 189 aa  90.9  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 428 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  34.95 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.95 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  53.85 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  29.63 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 415 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  57.14 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  38.38 
 
 		 214 aa  50.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 182 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 203 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  60 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 429 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 244 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 414 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1513  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000721449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  29.29 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 193 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 217 aa  41.2  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>