63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3625 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  46.94 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  45.85 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  45.08 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  48.28 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  47.54 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  51.79 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.36 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 415 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 428 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.08 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  37.68 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  51.16 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 181 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 429 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 414 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>