230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4304 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.2 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  38.2 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  45.51 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  33.54 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 415 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.65 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 428 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 429 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  28.82 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  31.78 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 207 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  36.92 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  43.64 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 677 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  40 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  48.08 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>