292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2126 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  62.07 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  62.86 
 
 		 181 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  63.95 
 
 		 203 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  53.18 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  46.11 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.61 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  38.61 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  42.14 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  32.9 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.42 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.18 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
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NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  34.96 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  40.58 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  38.67 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  32.77 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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