183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2883 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  69.09 
 
 		 233 aa  292  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  69.09 
 
 		 233 aa  292  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  39.91 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  37.56 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.29 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.33 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.33 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.39 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.66 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.16 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.16 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.16 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.16 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  29.33 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 277 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.51 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  43.14 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  28.7 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.9 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>