232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0140 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  43.98 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  29.17 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 428 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  58.33 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  51.52 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  50.7 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  52.83 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  43.06 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  50.94 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  29.01 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 429 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 414 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  38.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>