64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3484 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  36.41 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  47.13 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  40.77 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  35.82 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.51 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.28 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  46.81 
 
 		 212 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 186 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 125 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 677 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 178 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 244 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>