131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3208 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  61.5 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  62.57 
 
 		 196 aa  208  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  61.86 
 
 		 195 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  51.34 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  44.92 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  55 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  33.53 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  46.88 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  32.72 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.45 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.45 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  32.47 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  34.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  33.06 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  32.76 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  39.13 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.93 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  28.89 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  28.68 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  40.74 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>