60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3989 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  37.84 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  39.68 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  33.01 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  43.64 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  25.15 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  31.94 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 190 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 237 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 196 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  30.72 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>