37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7784 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  31.87 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  44.29 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  48.15 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  53.06 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  27.42 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  44.07 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  37.31 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  19.14 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 194 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>