124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2968 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
208 aa  407  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  97.12 
 
 
208 aa  367  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  91.35 
 
 
207 aa  347  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  36.05 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  32.29 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  41.94 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  37.8 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  44.26 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
189 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  25.91 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
178 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  29.65 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  43.1 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  53.66 
 
 
212 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.82 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  35.82 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 
196 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
241 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
189 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  26.78 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.84 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
429 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  37.21 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>