238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1092 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50.38 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  46.62 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  52.44 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32.8 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  30.22 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  31.8 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  41.03 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  39.02 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  30.4 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.22 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.05 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  32.05 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  34.25 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.54 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.95 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>