More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6786 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2752  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  31.09 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  53.7 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.63 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  39.66 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  30.16 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5139  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 275 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 317 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  42.59 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>