275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1498 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 228 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 244 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 227 aa  87.8  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 222 aa  87.8  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 477 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 477 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 285 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  29.37 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  29.03 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  30 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 221 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 286 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  26.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>