239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3451 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1041  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  43.1 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  43.1 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  23.03 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.4 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  38.18 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 316 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 316 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 316 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  33.85 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 317 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  42.11 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  42.11 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 276 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 275 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>