More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0070 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  390  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  38.71 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  25.87 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  27.08 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 168 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  46.75 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  35.11 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  51.85 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  34.04 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  34.04 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  42.25 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  41.43 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31770  hypothetical protein  27.92 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 268 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 235 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>