More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0511 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5540  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00941347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  39.62 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.38 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.29 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  32.48 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  40.98 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.71 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 330 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.35 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  30.3 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 175 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  31.33 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  26.35 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 321 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 321 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 321 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 321 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.91 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  28.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>