More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3937 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  29.51 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  29.26 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  28.89 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 317 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 308 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  37.31 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 346 aa  47.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 220 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  30.47 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  34.44 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>