More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9308 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  62.84 
 
 
222 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
218 aa  204  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 
224 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 
227 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 
241 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  58.33 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
204 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  49.15 
 
 
205 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
201 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  45.76 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 
286 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  28.81 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 
211 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
202 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
291 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
208 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
204 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 
183 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  51.02 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  34.23 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  34.55 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>