180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2004 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  39.71 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 199 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 195 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  32.56 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  31.11 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 125 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  32.1 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  46.3 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  23.22 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  41.89 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>