292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6787 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2752  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 193 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  43.28 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  43.24 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  43.24 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  50.94 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.93 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  45.61 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  40.28 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  29.9 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  41.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  47.46 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  40.62 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  33.04 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>