More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3984 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 298 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  52 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  45 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 168 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  34.68 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  34.68 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 270 aa  48.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 235 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  26.74 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>