More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5248 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 178 aa  347  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 203 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  45.89 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  44.14 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 428 aa  67.8  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  50.72 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  50 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  48.57 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 255 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 424 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  41.18 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 298 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  42.86 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>