More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1610 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 424 aa  877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  44.89 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 422 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 209 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 260 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.25 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 233 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 205 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 770 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.55 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 175 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 192 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 215 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 213 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 212 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 178 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 202 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 206 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 213 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 189 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  42.11 
 
 		 213 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 243 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 202 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 208 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  26.87 
 
 		 204 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 245 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 168 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 227 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 224 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 224 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 198 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 212 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 238 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 224 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 224 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  25.87 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 217 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 211 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 186 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  25 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  41.54 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.02 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>