More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0336 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  82.54 
 
 		 191 aa  330  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  74.6 
 
 		 191 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  70.37 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 199 aa  200  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  51.1 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 189 aa  177  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 437 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  31.96 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  26.8 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 287 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 424 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  50 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.9 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>