More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0807 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 		 232 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 204 aa  416  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 204 aa  416  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 232 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  93.63 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  23.56 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 261 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  31.13 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  46.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  30.36 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.51 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.3 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 424 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>