More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3068 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.23 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 437 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  24.71 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  28.37 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  26.9 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  24.39 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  20.74 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 285 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 385 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>