More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0697 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 191 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 216 aa  97.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.37 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  28.32 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  49.12 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  36.99 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>