More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5711 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  503  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 194 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 194 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  33.51 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  24.59 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 367 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  42.42 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  37.66 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  27.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 204 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 477 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  24.47 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 199 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 477 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  26.94 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>