More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3554 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  34.18 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  25.56 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  24.75 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.95 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.73 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>