More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0452 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
215 aa  231  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.89 
 
 
287 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
200 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
308 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  33.13 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
212 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
349 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  31.18 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  26.47 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  24.66 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  27.75 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  23.58 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  25.68 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  24.64 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
297 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  27.56 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  23.86 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
677 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  23.71 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  21.53 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  26.15 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  26.15 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  26.15 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  26.15 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  25 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  22.58 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
245 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  25 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  24.26 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.15 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  25.53 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.15 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  24.26 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  27.96 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
185 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  23.53 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  25.74 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  25.74 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.547125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>