More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2803 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  99.48 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  71.73 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5427  TetR family transcriptional regulator  67.44 
 
 		 97 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  25.26 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  29.26 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 245 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  25.26 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  26.9 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  28.42 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  26.38 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  25.67 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  25.89 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  25.25 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  26.14 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  24.37 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  44.64 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  27.68 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  25.97 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  24.34 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  24.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  23.68 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  23.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  30.3 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4880  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  26.29 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 677 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  23.83 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  27.52 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  27.52 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 245 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>