More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1921 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.32 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  43.06 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 367 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  34.78 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  38.52 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.92 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  28.72 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  27.7 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  26.72 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 291 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  24.62 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  26.34 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  25.38 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  26.61 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  24.62 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>