198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2881 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 367 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 202 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 206 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 197 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  38.12 
 
 		 205 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 203 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.17 
 
 		 203 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 204 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  32.85 
 
 		 207 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 196 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  36.18 
 
 		 206 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 197 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 206 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 206 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  27.27 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  32.99 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 196 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 194 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 194 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  25.13 
 
 		 194 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  28.35 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 195 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  27.45 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  26.96 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  29.13 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  25.49 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  24.62 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.63 
 
 		 197 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  29.85 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 177 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 177 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 214 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  28.5 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  28.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  28.08 
 
 		 194 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  27.5 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  24.04 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  24.04 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  28.86 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  24.04 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  27.41 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  27.45 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  24.4 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  27.32 
 
 		 195 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  27.8 
 
 		 194 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  28.08 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  28.08 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  24.76 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 207 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  27.47 
 
 		 201 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  25.13 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  25.64 
 
 		 192 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>