More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2742 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  42.93 
 
 		 221 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  41.78 
 
 		 269 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  37.38 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  36.81 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  36.57 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  39.67 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  38.41 
 
 		 346 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  36.73 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  33.63 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>