296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2529 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 206 aa  244  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 367 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 196 aa  98.2  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.3 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  33.01 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  34.76 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  35.88 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  33.09 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  31.47 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  23.74 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  25.85 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  25.85 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  25.85 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  25.85 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  25.62 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.7 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  27.5 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.7 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  36.84 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.4 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  27.94 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  27.94 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  27.94 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  27.94 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>