275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7752 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  38.78 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  32.76 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  31.16 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  52.38 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  32.07 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  25.87 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  28.04 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  27.74 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  28.06 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  38.57 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  26.32 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  27.01 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  24.11 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  25 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  22.68 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  29.38 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  25.19 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  34.29 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.84 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  22.02 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  22.02 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  28.11 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>